其一，前者不存在中止、中断的制度，起诉期限一旦期满，不能再继续或重新起算;后者可以依法中止、中断或延长。民事诉讼时效中止事由消失后，时效继续计算，中断事由消失后，时效重新计算。时效期满后行政诉讼起诉期限和民事诉讼时效的区别，如有法定事由，还可以依法延长。

其二，法院是否主动审查不同。行政诉讼起诉期限，法院在立案和审理环节应当主动审查，无论被告是否提出原告起诉已过起诉期限的抗辩，只要法院经审查确已超过起诉期限的，均应裁定不予立案或驳回起诉。民事诉讼时效法院不应主动审查，无论在立案还是审理环节，法院均不能主动审查诉讼时效。只有在审理阶段，经被告提出时效抗辩，且法院经审查原告起诉确实超过诉讼时效的，才可以判决驳回原告诉讼请求。

其三，法律后果不同。行政诉讼超过起诉期限的，法院将不予立案或驳回起诉，法院对案件经不再进行实质审理，*丧失通过法院解决行政纠纷的权利。民事诉讼时效届满，并不必然使原告丧失实体权利，只要被告没有提出时效抗辩，法院仍应对案件进行实质审查并作出裁判。

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